Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS45Q9NRW7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms