Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPHK2Q9NRA0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPHK2Q9NRA0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms