Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
INCENPQ9NQS7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
INCENPQ9NQS7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms