Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN4Q9NQC3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN4Q9NQC3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms