Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK-5Q9HDB9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK-5Q9HDB9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms