Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VAT1LQ9HCJ6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VAT1LQ9HCJ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms