Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM12Q9H4Q4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM12Q9H4Q4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms