Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms