Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIOBPQ9H2D6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms