Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIF3L1Q9GZT8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIF3L1Q9GZT8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIF3L1Q9GZT8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms