Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms