Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDGFDQ9GZP0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PDGFDQ9GZP0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms