Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NSD3Q9BZ95 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NSD3Q9BZ95 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms