Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms