Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLDIP3Q9BY77 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
POLDIP3Q9BY77 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms