Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
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