Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C1QTNF3Q9BXJ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms