Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC94Q9BW85 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms