Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT11Q9BT88 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms