Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TINF2Q9BSI4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms