Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LPIN3Q9BQK8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPIN3Q9BQK8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms