Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA1CQ9BQE3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA1CQ9BQE3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms