Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCNS3Q9BQ31 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNS3Q9BQ31 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms