Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUSP9Q99956 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP9Q99956 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms