Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2Q96Q42 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2Q96Q42 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms