Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
LMTK3Q96Q04 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
LMTK3Q96Q04 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms