Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ODF3Q96PU9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ODF3Q96PU9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms