Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOX2Q96NM4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOX2Q96NM4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms