Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COG8Q96MW5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms