Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
JSRP1Q96MG2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms