Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
USP47Q96K76 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP47Q96K76 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms