Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDLIM2Q96JY6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
PDLIM2Q96JY6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms