Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK5RAP3Q96JB5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK5RAP3Q96JB5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms