Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CELF6Q96J87 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF6Q96J87 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF6Q96J87 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CELF6Q96J87 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF6Q96J87 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CELF6Q96J87 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CELF6Q96J87 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms