Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCC12Q96J65 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCC12Q96J65 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms