Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SGSM3Q96HU1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSM3Q96HU1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms