Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BORCS6Q96GS4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BORCS6Q96GS4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms