Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NEIL1Q96FI4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms