Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG3

TIFA, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIFAQ96CG3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TIFAQ96CG3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TIFAQ96CG3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms