Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC102AQ96A19 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC102AQ96A19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms