Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF4BQ92750 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms