Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRUQ92729 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRUQ92729 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms