Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3AQ92664 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3AQ92664 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms