Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AP3S1Q92572 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms