Protein–RNA interactions for Protein: Q92529

SHC3, SHC-transforming protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC3Q92529 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHC3Q92529 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC3Q92529 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms