Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CSRNP3Q8WYN3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CSRNP3Q8WYN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms