Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PSPC1Q8WXF1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PSPC1Q8WXF1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PSPC1Q8WXF1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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