Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATRIPQ8WXE1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATRIPQ8WXE1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms