Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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C15orf40Q8WUR7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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C15orf40Q8WUR7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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C15orf40Q8WUR7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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C15orf40Q8WUR7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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C15orf40Q8WUR7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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C15orf40Q8WUR7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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C15orf40Q8WUR7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C15orf40Q8WUR7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C15orf40Q8WUR7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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