Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC12Q8WUD4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC12Q8WUD4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms